菅第２次改造内閣では各省庁の副大臣、大臣政務官入れ替えは小幅にとどまった。国土交通省の池口修次、三井辨雄両副大臣、小泉俊明、津川祥吾、市村浩一郎の各大臣政務官は、いずれも留任となった。